MindSpore数据集加载-调试小工具 py-spy

发布时间:2022-08-19 12:06

编写MindSpore数据集加载代码的时候,有时候会遇到一些迷惑的代码行为,比如不知道代码卡在哪里不动了,似乎处理的很慢,或者写了死循环的逻辑。这些问题往往会花费很多精力打点去调试python代码,那么有没有方便的工具帮我们这么做呢—— 有请今天的主角:py-spypy-spy 介绍引用官方的话:py-spy是Python程序的采样分析器。它可以让您可视化Python程序花费的时间在什么上,而无需重新启动程序或以任何方式修改代码。py-spy开销极低:它是用Rust编写的,以提高速度,并且与分析的Python程序不在相同的进程中运行。这意味着py-spy可以安全地用于生产Python代码。官方github地址:https://github.com/benfred/py...如果有相关的问题也可以去github提问。py-spy 安装pip install py-spy安装后使用 py-spy -h可以验证安装,并查看使用帮助。py-spy -hpy-spy 0.3.12
Sampling profiler for Python programs

USAGE:

py-spy 

OPTIONS:

-h, --help       Print help information
-V, --version    Print version information

SUBCOMMANDS:

record    Records stack trace information to a flamegraph, speedscope or raw file
top       Displays a top like view of functions consuming CPU
dump      Dumps stack traces for a target program to stdout
help      Print this message or the help of the given subcommand(s)

py-spy 基本功能一般在命令行中运行py-spy,并对py-spy传入要分析的进程的PID或要运行的python程序。py-spy具有三个子命令record,top和dump:record生成火焰图
图片
top实时查看每个函数运行时间并统计
MindSpore数据集加载-调试小工具 py-spy_第1张图片
dump显示每个python线程的当前调用堆栈
MindSpore数据集加载-调试小工具 py-spy_第2张图片
使用py-spy调试MindSpore数据集加载构造一个数据迭代很慢的场景先上一个经典代码test_dataset.pyimport mindspore.dataset as ds
import numpy as np
import time
class DatasetGenerator:

def __init__(self):
    pass

def __getitem__(self, item):
    self.do_something()
    return (np.array([item]),)

def do_something(self):
    cnt = 0
    for i in range(100000000):
        cnt += 1

def __len__(self):
    return 50

def test_generator_0():

data1 = ds.GeneratorDataset(DatasetGenerator(), ["data"])

start = time.time()
for item in data1.create_dict_iterator(num_epochs=1, output_numpy=True):
    print("data time:", time.time() - start)
    start = time.time()

虽然这个用例比较简单,但是确实会看到迭代的时候出数据很慢,运行一下可以看到data time: 5.431891679763794
data time: 5.6114866733551025
data time: 5.38549542427063
data time: 5.577831268310547
基本上5秒才读出一条数据,50条数据就是250秒!这才50条数据,如果10w条呢,这个读取时间难以接受。那么究竟问题出现在哪里呢?(虽然明眼能看到do_something这个函数有点问题,但是我们现在假装不知道)我们需要py-spy帮我们定位一下问题。使用py-spy的top功能查看调用栈和时间占比我们重新运行一下这个脚本python test_dataset.py &注意我们允许的时候加了 & 使其可以在后台运行,同时返回一个pid,比如这样
图片
我们得到了这个python的进程id 116079,有了这个pid之后,我们就可以利用py-spy给我们做实时分析了,接下来我们在命令行中输入py-spy top --pid 116079假如遇到这个提示Permission Denied: Try running again with elevated permissions by going 'sudo env "PATH=$PATH" !!'
重新在命令行输入这个即可sudo env “PATH=$PATH” !!此时将会看到py-spy列出了调用栈及相关的函数用时占比:
MindSpore数据集加载-调试小工具 py-spy_第3张图片
直观地从这个调用栈分析,do_something这个函数居然占用了100%的运行时间,运行超过了50+s,肯定有某些问题!或是处理逻辑太慢,或是写了死循环?那么我们就可以快速来到代码的这里看看发生什么事了def do_something(self):

cnt = 0
for i in range(100000000):
    cnt += 1

天哪!这里居然有一个一亿次的循环加法,究竟是谁写的代码!(不是我)我们可以通过优化这一部分代码,来提升整体数据处理的速度。总的来说py-spy是一个挺方便的工具,帮助用户快速定位python的性能问题,除了top功能之外,py-spy也提供了dump功能把完整的堆栈写入到本地方便分析。当我们在 debug 一个线上正在运行的程序的时候,只需要提供进程id,py-spy就可以直接接入使用。

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